Как в универсальном отчете сделать, чтобы галочка на закладке отбор стояла всегда по умолчанию, при открытии отчета?

Ну, надо себя как-то заставить...

(1) ближе к сути

(2) Ну, я бы начал с того, что с открытыми глазами посмотрел, где задаются те самые настройки по умолчанию

так это да, вот тут добавляется отбор:
// Добавление предопределенных отборов отчета.
УниверсальныйОтчет.ДобавитьОтбор("ТипЦен");
только это не ставит по умолчанию галочку в этом отборе)

сохранить в настройке

хотя передать если параметр Истина, то вроде галочка стоит по умолчанию

(5) как вариант

но я хотел узнать, как программно это задать

(4) И? Тебя током бьет, если пытаешься после вызова этой процедуры флаг установить, или что?