База с 2018 года, у организации регистрация в ИФНС не менялась.
В 2020 появилось обособл. подразделение. И теперь в движениях у старых документов, что были до появления обособл. подразделения, почему-то регистрация этого нового подразделения. Перепровожу начисления, выплаты, регистрация становится правильной. Но на рабочей базе то не будешь за 2.5 года перепроводить. Да и хотелось разобраться как так получилось ?

В истории по подразделениям только одна запись, т.е. регистрация не менялась.

может в конфиге есть код, который при появление обособки что-то лопатит?

Полностью типовая ЗУП 3.1

Восстановил через проверку регистрации. Но так и не понял почему так получилось.

(4) У меня в одной конторе похожая ситуация. Перепроводил интерактивно? Групповое проведение не прокатывает?
Как запускал проверку регистрации?

Я не перепроводил. Проверка регистрации в ИФНС(Налоги и взносы -Сервис -Проверка регистрации в ИФНС). Показала ошибки, нажал "исправить"

(6) Мой вопрос был в связи с "Перепровожу начисления, выплаты, регистрация становится правильной"
В моём случае перепроведения не помогали. И проверка регистрации тоже не дала эффекта.

Перепроведение не поможет только в том случае если начисления типа премий и т.п. Тогда надо еще и перезаполнять.

(1) например при обмене приехала

(9) А ведь действительно. Глянул в бух. базу, кто-то в головной организации прописал КПП обособл. подразделения, забив даже на то, что там красным написано предупреждение.