Для документа добавлена дополнительная произвольная форма, в которую добавлен один реквизит ДокументОбъект и несколько полей ввода, связанных с соответствующими реквизитами ДокументОбъект'а.
Из основной формы документа, по кнопке, открывается данная форма:

ДопФорма = ПолучитьФорму("унвФормаДополнительныхРеквизитов",ЭтаФорма);
ДопФорма.ДокументОбъект = ЭтотОбъект;
ДопФорма.ОткрытьМодально();

При этом корректно заполняются значения полей ввода дополнительной формы, далее меняем значения, закрываем доп. форму, открываем снова доп форму, все значения на месте... но если записать документ, то изменения не сохраняются, собственно отчего так?

Отладчик в руки и вперед.

Все, ветку можно закрывать, нашел в чем косяк

от того что реквизиты формы не связаны с реквизитами объекта (документа) - соответственно ни где не хранятся

"произвольная форма"

(3), (4) нет не от этого, с произвольной формой и реквизитами все нормально, нашел в обработчике ПередЗаписью() перезаполнение этих реквизитов по документу-основанию