Есть контрагент, есть оплаты от него на счет 62.1 и есть реализации. Но по какой-то причине не все документы реализаций формируют проводки по счету "Н02.2" и соответственно не отражаются в книге доходов и расходов.
Договор один, свойства у товаров одинаковые. Причинно-следственной связи установить не удалось, модуль без поллитра не разобраться.

В чем может быть причина ?

Разобрался, товар который продается должен быть уже оплачен поставщику.