При отражении з\п в регл учете выскикивает следующая ошибка Внимание! При формировании проводок обнаружены сотрудники, по которым нет данных для формирования проводок по страховым взносам.
Сотрудники по которым сформированы проводки по страховым взносам по начислениям нарастающим итогом с начала года.


Куда копать? Проводки для него стандартные. Начисления есть.

зарплата за счет прибыли есть?

з\п нет. есть доп начисления.

Не ЕНВД случаем? Тогда вводите процент деятельности, пусть даже самый маленький.

больничные листы и их корректировки

(3) не ЕНВД.
можно ли руками ввести суммы по налогам в документ? и чем это потом черевато?

сторно есть?
Глянь в регистрах расчета по нему за месяц