Windows 7
При попытке удалить любой файл формата pdf машина пишет, что он занят другим приложением. При удалении файлов других форматов такого не наблюдается.

Как выяснить какое приложение так бережно охраняет пдфки?

http://download.sysinternals.com/files/ProcessExplorer.zip

анлокер еще помогает разблокировать и сразу удалить такие файлы.

А их превьюшки не показывает в проводнике, случайно?

anvir task manager
умеет дохренища всякого еще

или http://ru.systemexplorer.net/

загрузись в безопасном режиме

какой антивирь стоит?

(3)А как сделать так что бы они показывались?

(8) Настроить ассоциации, и "Огромные значки".

ну или не совсем огромные