Доброе время суток!
ЗУП 2.5 (2.5.66.2)

При начислении зарплаты по одной организации в начисления для каждого сотрудника залетает вид расчета, помеченный на удаление, и по нему происходит расчет зарплаты

В "Плановых начислениях" такого вида расчета у сотрудников не назначено, проверено. Ни для одного сотрудника

ТИИ не помогло, подобную ошибку на форуме не нашла, на сайте 1С для данного релиза она тоже не зарегистрирована

Подскажите, куда посмотреть?

Ставит этот вид расчета вообще всем, и работающим, и увольняющимся

В конфигурацию внесены изменения? - если да, то смотрите обработку заполнения документа Начисление зарплаты

(28) Может где-то в "показателях расчета зп". Сделай поиск по ссылке.

(0) Смотри регистр "надбавки по штатному расписанию".