Наша организация посредник между МТС и конечным покупателем. Главный бухгалтер утверждает, что в сф, которую мы перевыставляем, в качестве поставщика должен печататься МТС. Права ли она и как это сделать?

сформировать с-ф на основании отчета комитенту.

(0) Права.  Вы работаете по договору поручения или комиссии?

(1) Не факт.

(1) полученный сф?

(2) главбух говорит, что мы работает по доверенности от МТС.

Я правильно понял, что это работает так.
Мы заполняем отчет комитенту и отправляем ему.
Комитент получает наш отчет и заполняет на его основе "отчет комиссионера о продажах" и распечатывает сф, где Продавец он, а покупатель это конечный потребитель услуги, а потом передает их посреднику (или конечному покупателю?). Т. е. распечатывать такую сф должен комитент.