Смысл в чем при проведение документа Заказ, проверяются скидки и рентабельность. Если они не соответствуют чем то, то нельзя провести заказ, и создается напоминание руководителю (РегистрСведений.Напоминания).
Проблема в том, что я делаю Отказ = Истина (если скидки не соответтсвуют), то он мне не фиксирует записи в этот регистр напоминаний, и соответственно никакие напоминания руководителю не приходят.

Есть идеи как можно обойти?

убрать подчинение регистратору у РС

пиши вне транзакции. например через фоновое задание

что мешает отказ сбросить перед записью РС?

(1) и независимый и так

(3) т.е.
Отказ = Ложь;

// Запись в РС

ОТказ = Истина;

Вижу ток 1 вариант, делать Напоминание ПослеЗаписи, а при проведение смотреть снова, и если не было утверждения, но не давать проводить

(0) Пиши в журнал регистрации. Регламентом обрабатывай записи журнала регистрации.

(5) Для проведения документа открывается транзакция,если мы откроем ещё транзакцию,то они будут вложенные,и есть подозрение,что не сработает.