Существует обособленное подразделение в структуре организации.
В нем проставлено отсутствие РК (1.00)
Тем не менее РК считает.
Где еще нужно подправить?

(0) РК это плановое начисление конкретного сотрудника. РК в справочнике подразделений срабатывает только при приеме/перемещении сотрудника в это подразделение - ему назначается вид расчета "Районный коэффициент" с соответствующим показателем. Недостаточно убрать РК в подразделении, нужно еще прекратить плановое начисление у всех сотрудников этого подразделения.

Унифицированная форма т-3 из штатного расписания
Московский филиал     12    Директор филиала    1    20 000,00        30%                                    26 000,00    
Московский филиал     12    Инженер РЗА МФ    1    18 000,00        30%                                    23 400,00    
Московский филиал     12    Инженер ЭТЛ МФ    4    17 300,00        30%                                    89 960,00    
Московский филиал     12    Менеджер МФ    2    17 300,00        30%                                    44 980,00    
Московский филиал     12    Начальник ЭТЛ МФ    1    19 000,00        30%                                    24 700,00    

Существует только штатное, людей не назначали

(2) Если есть в штатном, но нет в плановых начислениях сотрудника, то и подтягивается из штатки.

(3) В штатном единицы стоят, сотрудников еще нет. Только штатное расписание.

(4) Я про то и говорю, если в штатном расписании указана надбавка "Районный коэффициент", то она будет начисляться ВСЕМ сотрудникам, находящимся на этой позиции штатного расписания. Надо чистить штатное расписание