в ноябре сотруднику вместе с ЗП начислили отпуск с 02 по 08 декабря и выплатили, в декабре послали его в командировку (это сейлз + него премии от суммы сделки и он с удовольствием летает продать )  с 04 12 и соответственно исправили отпуска на 2 дня с 02 по 03 декабря.
корректировка отпуска делает ндфл с минусом ( это понятно, было 7 дней, осталось два) .
в отчёте анализ зп по сотрудникам появилсь колонки зачтено излишне удержанного ндфл и ндфл к зачёту в счёт будущих платежей , что мне непонятно , особенно про будущие платежи. сумма сторно отпуска была значительно меньше, чем всего начислено в декабре и по идее ничего на будущие платежи не должно оставаться
что смотреть ?

У него смотреть, что начисление отпуска скорей всего было Ноябрьское. Что теперь поставили при исправлении - смотреть. А так... Обычная ситуация, в том смысле, что отпуска у сотрудников регулярно происходят не так по факту, как были начислены и выплачены.

там вся дурь возникает именно по причине, что НДФЛ поставили жесткие сроки перечисления. Теперь вроде и исправить можно, но перечисление уже нет смысла исправлять. Что есть, то и есть. Годом "закрыться" должно. Пробуй в проверочном режиме "зарыть" по этому сотру год и посмотри будут с ним проблемы или нет. Скорей всего, что все сойдет и так.