Столкнулся с такой проблемой - из формы вызывается процедура серверного модуля. Если я в этой процедуре поставлю точку останова, то отладчик её проигнорирует, как будто и не попадает туда. Если же я в месте вызова процедуры нажму F11, то попаду в процедуру и смогу двигаться пошагово, но точку останова по-прежнему поставить не смогу (она отображается серым и игнорится).
Платформа 8.3.16.1063, файловая база данных. В отладке включено автоматическое подключение фоновых заданий (но это точно не оно).
Это баг или фича, о которой я не знаю? )))

(0) а вы пробовали включить и выключить? (с)
такое бывает когда конфигурации не соответствуют. например забыл сохранить изменения или применить их к БД.

(1) Спасибо, помогло! И в голову не пришло, т.к. я этот модуль не трогал совсем. Да и изменения в БД все были сохранены. То есть просто закрыл приложение (не конфигуратор!), открыл снова безо всяких изменений - и заработало ))