Как изменить даты создания/изменения/доступа файла?
Обработка должна сохранять файл из хранилища и ставить требуемые даты.

По-моему, только ВК.

Или как запаковать в zip не используя ЗаписьZipФайла?
Или как использовать ЗаписьZipФайла что-бы он не пихал в заголовок информацию по этим датам?
Через командную строку rarom рассматриваю в последнюю очередь, как крайний вариант.

(1) Да ВК, есть на примете? или через COM

Файл (File)
УстановитьВремяИзменения (SetModificationTime)
Синтаксис:
УстановитьВремяИзменения(<ВремяИзменения>)
Параметры:
<ВремяИзменения> (обязательный)
Тип: Дата.
Устанавливаемое местное время изменения файла.
Описание:
Устанавливает время последнего изменения файла.
Доступность:
Тонкий клиент, веб-клиент, мобильный клиент, сервер, толстый клиент, внешнее соединение, мобильное приложение (клиент), мобильное приложение (сервер).
Примечание:
Применим только к файлам, которые реально существуют.
Для работы метода на веб-клиенте необходимо предварительно подключить расширение работы с файлами.
В режиме совместимости конфигурации устанавливает местное время последней модификации файла с ошибкой NTFS. Если файл изменен летом, а устанавливается зимой, то установленное время опережает на 1 час. Если файл изменен зимой, а устанавливается летом, то установленное время отстает на 1 час.
Если установлен режим совместимости Версия8_2_13 или выше, то время выдается без ошибки.
При работе под управлением ОС Windows, если время изменения файла меньше 1 января 1601 года (UTC), генерируется исключение.
Пример:
ВыбФайл.УстановитьВремяИзменения(ТекущаяДата());
См. также:
Файл, метод НачатьУстановкуВремениИзменения
Использование в версии:
Доступен, начиная с версии 8.0.
     Методическая информация

(4) это знаю

Экспериментальным методом выявлено, что ЗаписьZipФайла создает идентичные побитно файлы если в содержимых файлах равны даты создания/изменения/доступа

winrar при упаковке в zip смотрит только на дату изменения. Побитно архивы получаются идентичными при разных других датах.